Dirección de Comunicaciones
Arriba Francisco José Martínez, Lina María
Vera Cala y Carlos Jaime Barrios, de la es-
cuela de biología, de medicina y sistemas
Después de
resultar ganador de la convocatoria Mincienciatón promovida por el Gobierno
Nacional a través del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, el
proyecto liderado por la Universidad Industrial de Santander presentó
recientemente los resultados del estudio que permite rápidamente la
identificación del virus SARS-CoV-2 y nuevas variantes, mediante la
caracterización de su información genómica.
Los
resultados arrojados demuestran que es posible complementar y mejorar la
calidad de los sistemas de diagnóstico del virus por RT-PCR y además determinar
la presencia de nuevas variantes en un tiempo más corto y a bajo costo, gracias
a la creación de dos fórmulas o soluciones químicas que permiten el estudio de
las características del genoma del virus SARS-CoV-2 y la aplicación de la supercomputación en el tratamiento de
datos.
Una de esas
fórmulas recibe el nombre de Colombia-UIS (COL-UIS) y es la encargada de
desenrollar la información genética y aumentar la calidad del resultado del
diagnóstico por RT-PCR. La otra formulación es Colombia-UIS-dNTPs
(COL-UIS-dNTPs) y contiene las cantidades de moléculas para obtener una copia
del genoma del virus SARS-CoV-2 y pueda ser secuenciada con tecnología Ion Torrent.
Este es el
resultado del trabajo liderado por los profesores e investigadores de la
Universidad Industrial de Santander, Francisco
José Martínez Pérez de la Escuela de Biología, Lina María Vera Cala de la
Escuela de Medicina y Carlos Jaime Barrios de la Escuela de Ingeniería de
Sistemas e Informática. El proyecto fue uno de los 25 seleccionados en el
llamado nacional que hizo el MinCiencias durante el 2020 convocando a
investigadores de diferentes regiones del país para encontrar soluciones ante la
problemática del COVID-19.
“Los
resultados son exitosos y prometedores ya que demostramos que si es posible
identificar el virus SARS-CoV-2 y que podemos complementar los sistemas de
diagnóstico por RT-PCR con la información de uno de sus genes que no se había
utilizado, además de corroborar que COL-UIS puede ser utilizada exitosamente en
los sistemas de identificación del virus que utiliza la Organización Mundial de
la Salud y el Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades conocido
como CDC. Por lo tanto, se puede realizar con 3 regiones lo que mejora
significativamente el resultado e inclusive con 10 muestras de pacientes en el
mismo tubo", comentó al respecto el profesor Francisco José Martínez.
En relación
con el estudio genómico desarrollado, el profesor Martínez agregó que la
formulación COL-UIS-dNTPs permite obtener la copia completa del genoma de
SARS-CoV-2 e inclusive aumenta la cantidad de producto final de 1,5 a 2 veces
más respecto al protocolo que se emplea actualmente para la secuenciación
genómica. “La secuenciación del producto sea bien con el sistema de
purificación o con las modificaciones permitió obtener 11 genomas sin regiones
incompletas por lo que fueron aceptados en la base de datos internacional
GISAID en menos de 5 minutos”.
Aporte de la Supercomputación
Según los
investigadores, en este estudio fue fundamental el aporte del Centro de
Computación Científica y de Alto Rendimiento - SC3UIS, bajo el liderazgo del
profesor Carlos Jaime Barrios, donde se desarrollaron aplicaciones en la
SuperComputadora GUANE-1 que permitieron analizar los miles de genomas del
virus SARS-CoV-2 en cuestión de segundos u horas dependiendo de la cantidad
mensual. De no haber sido por este importante aporte, estos análisis tardarían
semanas, meses o más de un año al ser tratados en una computadora tradicional.
Con la
información el área de genómica se desarrollaron las moléculas para las
regiones del virus que no habían sido consideradas en su momento, fue allí
donde surgieron las formulaciones de COL-UIS y COL-UIS-dNTPs que permitieron
establecer las mejores condiciones físicas y biológicas para obtener resultados
que corresponden a la realidad biológica del virus. 
Centro de computación científico
y de alto rendimiento de la UIS
El proyecto
que arrancó a medios del mes de marzo de 2020 cuando fue presentado ante la
convocatoria nacional Mincienciatón, ha contado con la participación de las
estudiantes de la Escuela de Biología Lizeth Johana Forero Buitrago, Carolina
Sofía Torres Jiménez, Erika Lizarazo Gutiérrez, y Gloria Patricia Gómez Cáceres
de la Escuela de Diseño Industrial y Sareth Daniela Hazbon Manrique. También,
los egresados UIS de la Escuela de Biología Cristian Enrique Cadena Caballero, Diego Rueda Plata de la Escuela
de Sistemas y Leidy Johana Cárdenas
Solano de la Escuela de Ingeniería Industrial.
¿Qué viene para el proyecto?
Los
investigadores esperan que este estudio sirva como referencia para mejorar los
procesos de identificación del virus SARS-CoV-2 y el seguimiento de las nuevas
variantes y otros virus que apoyen al sistema de vigilancia genómica. De igual
forma esperan la implementación de las soluciones de desenrollamiento (COL-UIS)
y nucleótidos (COL-UIS-dNTPs) en laboratorios del país que realizan el
diagnóstico por RT-PCR. Este nuevo procedimiento podría apoyar también en la
identificación del virus de la influenza A H1N1.
Recientemente
el profesor Francisco Martínez presentó ante la Ministra de Ciencia, Tecnología
e Innovación, Mabel Gisela Torres Torres y miembros del gabinete presidencial,
los resultados de este proyecto abanderado por la Universidad Industrial de
Santander. En esta oportunidad se destacó la importancia que tendrán las
tecnologías desarrollas por el proyecto en el diagnóstico y secuenciación
genómica además de los beneficios mundiales a la ciencia y la salud por ser
considerada una tecnología de rompimiento.
“Queremos que
los colombianos se enteren que estamos colocando todos nuestros conocimientos
para dar soluciones que contribuirán a disminuir los impactos y dispersión del
virus al mejorar el diagnóstico por RT-PCR por medio de procesos científicos de
alto nivel que ayudaran a establecer las características genómicas del virus
para beneficio de la salud”.
Fuente: Comunicaciones UIS
Ajuste de contenido y diagramación: bersoahoy.co
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